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for query gene Shew185_4138 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
402 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  90.55 
 
 
402 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  88.31 
 
 
402 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
402 aa  801    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  78.2 
 
 
400 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  99.75 
 
 
402 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  88.56 
 
 
402 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  87.56 
 
 
402 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
402 aa  801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  87.56 
 
 
402 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.19 
 
 
400 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.44 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.68 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.07 
 
 
401 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.72 
 
 
402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  71.72 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  70.35 
 
 
400 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  47.58 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  42.64 
 
 
423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  42.64 
 
 
397 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.15 
 
 
389 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  44.78 
 
 
400 aa  299  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.23 
 
 
399 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.94 
 
 
400 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.57 
 
 
397 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.49 
 
 
397 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.49 
 
 
397 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.62 
 
 
398 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 
398 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
396 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.52 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.58 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.83 
 
 
395 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
398 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.41 
 
 
401 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 
401 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.63 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  31.27 
 
 
371 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.06 
 
 
392 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  30.47 
 
 
371 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.06 
 
 
392 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.23 
 
 
399 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 
403 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  30 
 
 
395 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  30 
 
 
395 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  29.5 
 
 
396 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.05 
 
 
461 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  30 
 
 
395 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  30 
 
 
395 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
391 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.22 
 
 
393 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.02 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.02 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  31.4 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.77 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  31.1 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  29.5 
 
 
395 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.36 
 
 
402 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 
394 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.81 
 
 
401 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  27.62 
 
 
396 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.75 
 
 
405 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 
391 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  29.43 
 
 
409 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
420 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 
399 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  31.85 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  26.26 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.51 
 
 
400 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 
405 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 
430 aa  140  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  27.81 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.7 
 
 
415 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.14 
 
 
389 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  30.18 
 
 
401 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  34.89 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.14 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 
397 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.03 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.27 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.71 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.76 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  31.66 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  30.42 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.11 
 
 
401 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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