More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4365 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  789    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  45.3 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2695  major facilitator superfamily transporter  31.98 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4528  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.050595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.68 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.75 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.75 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.07 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  24.29 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  23.26 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.73 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  23.8 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  23.53 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  23.53 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  23.53 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  23.53 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  23.53 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  24.93 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  23.26 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.53 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  26.77 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.77 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.09 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  33.11 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  29.04 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  26 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  33.33 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  25.17 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.44 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  27.86 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  35.48 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  32.67 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  33.56 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  34.44 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  34.44 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  34.44 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2462  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  36.69 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  32 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  34.71 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>