More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1512 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 441 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2695  major facilitator superfamily transporter  65.31 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4528  major facilitator superfamily transporter  63.97 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.050595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  33.15 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.21 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  39.31 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  35.86 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.73 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.67 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.67 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.44 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.36 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  31.61 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  33.55 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.45 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.14 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  28.06 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.36 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.42 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  32.89 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  28.97 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  30.99 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  36.09 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.66 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  28.71 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 459 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  34.48 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  26.86 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  27.83 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  28.45 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  26.38 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.01 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  26.8 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  29.85 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  33.9 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  22.67 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>