189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88213 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  100 
 
 		 624 aa  1282    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  50.17 
 
 		 584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  43.38 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  40.23 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  31.77 
 
 		 521 aa  293  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  31.13 
 
 		 591 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  31.59 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  28.91 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  26.99 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  35.13 
 
 		 479 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  35.51 
 
 		 631 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  24.96 
 
 		 663 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  33.48 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  30.12 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  23.59 
 
 		 1057 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  34.84 
 
 		 308 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  32.86 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  32.84 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.5 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 398 aa  70.1  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  34.26 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 453 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 396 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.66 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  25.33 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 388 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.33 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.81 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.09 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.04 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1934  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 385 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 414 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 396 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  25.33 
 
 		 424 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 397 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  25.33 
 
 		 424 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 398 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 398 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.34 
 
 		 408 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 420 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 413 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 436 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 398 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 403 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 394 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 414 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 		 403 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 403 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 403 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.09 
 
 		 411 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  25.33 
 
 		 399 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 399 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 408 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 397 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 		 403 aa  54.3  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 389 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 410 aa  53.9  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 406 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  34.95 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.31 
 
 		 409 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 411 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>