44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47021 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1040    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  46.95 
 
 
532 aa  458  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  50.42 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  41.43 
 
 
521 aa  363  3e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  41.63 
 
 
517 aa  356  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  33.65 
 
 
536 aa  309  9e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  29.81 
 
 
584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  28.5 
 
 
624 aa  233  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  24.81 
 
 
591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  22.49 
 
 
530 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  22.89 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  20.34 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  22.46 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  23.87 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  21.69 
 
 
1057 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  25.57 
 
 
631 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
397 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.76 
 
 
406 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  27.01 
 
 
410 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  28.99 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  22.92 
 
 
308 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  22.8 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  27.08 
 
 
404 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.67 
 
 
406 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28.38 
 
 
424 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  26.19 
 
 
869 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  24.85 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.83 
 
 
431 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
420 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  28.26 
 
 
407 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.08 
 
 
416 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.44 
 
 
386 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 
392 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>