280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03850 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI03850  expressed protein  100 
 
 		 869 aa  1756    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  27.03 
 
 		 591 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  104  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  25.81 
 
 		 532 aa  89  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  26.29 
 
 		 479 aa  88.6  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  28.51 
 
 		 584 aa  87.8  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  23.15 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  27.91 
 
 		 536 aa  86.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  23.75 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  25.61 
 
 		 624 aa  78.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  25.47 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32.43 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  25.16 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 442 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.89 
 
 		 434 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  24.71 
 
 		 1057 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 421 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 424 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 419 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  29.92 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  34.86 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  34.86 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  23.26 
 
 		 517 aa  63.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  34.86 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  32.41 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  32.71 
 
 		 413 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1934  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 411 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  29.93 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 428 aa  60.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 395 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  32.91 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  27.67 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  28.66 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.76 
 
 		 411 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 397 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 412 aa  57  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 387 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.94 
 
 		 397 aa  57  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.1 
 
 		 411 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 406 aa  57  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  21.95 
 
 		 521 aa  57  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  28.33 
 
 		 422 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 548 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  28.37 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 418 aa  56.2  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 399 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 529 aa  55.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 574 aa  55.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 424 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 412 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.69 
 
 		 517 aa  55.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  27.74 
 
 		 411 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 395 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.21 
 
 		 511 aa  54.7  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 431 aa  54.7  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 513 aa  54.7  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 399 aa  54.3  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 513 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 401 aa  54.3  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.73 
 
 		 401 aa  54.3  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.42 
 
 		 487 aa  54.3  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>