221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31966 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  100 
 
 		 536 aa  1089    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  50.56 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  42.53 
 
 		 624 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  44.55 
 
 		 584 aa  455  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  36.57 
 
 		 521 aa  336  5e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  36.38 
 
 		 517 aa  321  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  33.46 
 
 		 591 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  33.65 
 
 		 509 aa  309  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  33.53 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  30.38 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  30.77 
 
 		 631 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  28.81 
 
 		 480 aa  156  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  26.99 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  23.06 
 
 		 576 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  26.59 
 
 		 663 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  34.13 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  23.06 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  23.28 
 
 		 1057 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  27.91 
 
 		 869 aa  71.2  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  28.97 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  30.53 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  23.14 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 408 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.06 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.64 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28.21 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.39 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.35 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  26.32 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 406 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  26.51 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.35 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  25.64 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  30.28 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  30.37 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.86 
 
 		 416 aa  57  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 397 aa  57  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  30 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  22.56 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  24.31 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  34.55 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.72 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  26.72 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>