44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28601 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  100 
 
 		 479 aa  978    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  50.42 
 
 		 509 aa  458  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  44.93 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  40.43 
 
 		 517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  39.15 
 
 		 521 aa  289  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  33.73 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  28.05 
 
 		 584 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  33.22 
 
 		 624 aa  153  8e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  25.5 
 
 		 591 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  22.85 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  24.91 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  26.54 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  23.17 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  23.97 
 
 		 1057 aa  63.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  24.66 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  32.91 
 
 		 869 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  25.4 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  24.88 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  22.59 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  33.33 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.86 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  29.27 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  22.64 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  28.29 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00233  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14500)  24.53 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06390  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 487 aa  43.9  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  24.5 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>