206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03260 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  39.56 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  36.41 
 
 		 591 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  32.38 
 
 		 530 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  34.13 
 
 		 536 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  30.28 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  32.54 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  30.99 
 
 		 532 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  34.84 
 
 		 624 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  31.02 
 
 		 869 aa  90.1  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  29.38 
 
 		 631 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  39.62 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  27.36 
 
 		 521 aa  79  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  31.36 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  27.57 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 439 aa  72.4  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  34.68 
 
 		 663 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  30.61 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 414 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.67 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  28.49 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.71 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.76 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.71 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  37 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  25.65 
 
 		 1057 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.47 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  25.71 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  32.53 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  25.4 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 397 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  33.71 
 
 		 417 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 493 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 493 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  32.17 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 493 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.49 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 419 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 428 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 415 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 454 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 396 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 454 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 454 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  34.04 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  24 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  27.71 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.71 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 455 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  34.48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  34.48 
 
 		 454 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  23.62 
 
 		 422 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>