77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28602 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  100 
 
 		 517 aa  1062    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  49.43 
 
 		 521 aa  468  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  47.98 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  41.18 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  36.38 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  40.43 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  31.74 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  32 
 
 		 624 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  28.27 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  26.35 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  21.33 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  23.04 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  26.79 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  24.1 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  25.2 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  27.57 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  23.23 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  22.22 
 
 		 1057 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  26.97 
 
 		 869 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  32 
 
 		 410 aa  57  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  28.75 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.99 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  22.39 
 
 		 401 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  26.04 
 
 		 426 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.71 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  27.14 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 391 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.07 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  27.43 
 
 		 477 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  28.39 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.06 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  20.56 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  24.11 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  24.37 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 418 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>