84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47685 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  100 
 
 		 521 aa  1060    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  48.96 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  49.81 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  41.62 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  36.57 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  31.27 
 
 		 624 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  39.57 
 
 		 479 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  30.61 
 
 		 584 aa  279  9e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  28.04 
 
 		 591 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  23.15 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  24.59 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  24.46 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  28.99 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  27.36 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  23.55 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  28.15 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  22.39 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  23.08 
 
 		 869 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  23.76 
 
 		 1057 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 396 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 406 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  24.17 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  25.34 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 428 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.44 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.55 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 430 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 411 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 404 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  23.23 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  27.13 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 400 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 398 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  26.35 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  25.76 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.85 
 
 		 420 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.23 
 
 		 487 aa  43.5  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 397 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>