115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44978 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  100 
 
 		 532 aa  1097    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  50.56 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  48.1 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  46.95 
 
 		 509 aa  458  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  47.96 
 
 		 517 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  40.21 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  42.17 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  44.93 
 
 		 479 aa  357  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  31.76 
 
 		 591 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  28.76 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  26.93 
 
 		 631 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  27.85 
 
 		 480 aa  137  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  24.32 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  23.86 
 
 		 663 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  25.05 
 
 		 1057 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  23.58 
 
 		 576 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  24.41 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  30.99 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  24 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  23.56 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.46 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 423 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 397 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  29.45 
 
 		 401 aa  53.9  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 389 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.27 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 391 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  24.67 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 423 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  25.15 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 397 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.7 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  30 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06390  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 390 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  26.71 
 
 		 419 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  24.22 
 
 		 417 aa  47.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 414 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  19.4 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.87 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  25.13 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.49 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  19.19 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.17 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.17 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>