More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2277 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  753    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  49.04 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  49.59 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1684  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 442 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  28.08 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  30.21 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  24.73 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.91 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  27.62 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  27.62 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.62 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.62 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.53 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.62 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  25.37 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.82 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.41 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  29.39 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  29.25 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  26.24 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  30.03 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.86 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  21.18 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.08 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  23.65 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  22.28 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.02 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  21 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 442 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  25.82 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.35 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>