More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1295 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  100 
 
 		 412 aa  822    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1356  major facilitator family transporter  98.93 
 
 		 374 aa  736    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6524  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39358  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6240  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 420 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5542  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1016  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3626  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0809302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4741  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.61 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.33 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.86 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0424  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.535045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.17 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.23 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.43 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  26.92 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.47 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.94 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 442 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.29 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.29 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  25.07 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.98 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  24.59 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  24.86 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.23 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.27 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  24.02 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4548  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  25.76 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.4 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.19 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  29.82 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  25.06 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  23.65 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  26.5 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  24.65 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.14 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  25.48 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>