99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0222 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  88.64 
 
 
400 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
397 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  62.12 
 
 
401 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  48.31 
 
 
414 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  47.68 
 
 
395 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  49.07 
 
 
409 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  46.59 
 
 
435 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  45.22 
 
 
412 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  45.98 
 
 
402 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  44.91 
 
 
404 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  40.28 
 
 
415 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  42.74 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
413 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
414 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  39.64 
 
 
431 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  35.45 
 
 
408 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
420 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
431 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.5 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.5 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.81 
 
 
397 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.75 
 
 
414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
408 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  33.44 
 
 
432 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.54 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  25.82 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  25.82 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 
398 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  26.96 
 
 
405 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  30.88 
 
 
400 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  26.33 
 
 
530 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
415 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.46 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  27.3 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.13 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  26.06 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  25.47 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.79 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  26.58 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  25.44 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.23 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  23.42 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.22 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  26.44 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.32 
 
 
421 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  34.21 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  27.81 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  26.22 
 
 
396 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
461 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.43 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  29.69 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  29.52 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
524 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  27.09 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.62 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  25.98 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
507 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.92 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  38.37 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  34.91 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
503 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  26.79 
 
 
465 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
528 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  28.12 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  34.17 
 
 
1065 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  28.85 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.31 
 
 
516 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 
630 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  36.11 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  30.33 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  25 
 
 
432 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  25.52 
 
 
439 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  33.96 
 
 
464 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.73 
 
 
519 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
527 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  33.02 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.65 
 
 
607 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  27.34 
 
 
425 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
480 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.5 
 
 
403 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>