86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0590 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  64.63 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  63.87 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  57.36 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  44 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  37.32 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.74 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  29.76 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.73 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.6 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  24.75 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  26 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  34.78 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25.92 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  27.3 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.83 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  29.25 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.96 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.88 
 
 		 484 aa  46.6  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.51 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  31.3 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  26.06 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  34.65 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.53 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.46 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.1 
 
 		 465 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  35.8 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  26.09 
 
 		 520 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.280694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.36 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  35 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.27 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>