183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0026 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  40.83 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  39.94 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1055  putative MFS transporter  41.9 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  27.11 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.65 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  27.73 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  25.29 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  24.05 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  30 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1200  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0259923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  25.07 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0844  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313239  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  39.68 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.59 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.71 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.78 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  32.08 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  32.08 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  37.33 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  37.33 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  31.29 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  33.68 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  33.68 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  31.29 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  31.29 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  23.35 
 
 		 530 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  31.29 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.4 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.77 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  31.68 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  24.06 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.61 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3312  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  23.53 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.67 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>