More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4285 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  98.54 
 
 
410 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  98.54 
 
 
410 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  55.35 
 
 
414 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  51.01 
 
 
397 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  57.03 
 
 
404 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.15 
 
 
407 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
399 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
415 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  33.05 
 
 
415 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  30.55 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
412 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  32.51 
 
 
395 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
395 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  33.88 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.62 
 
 
403 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.62 
 
 
403 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
403 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.4 
 
 
530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  35.2 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  31.9 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  33.33 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  35.21 
 
 
431 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  29.27 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
412 aa  126  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 
398 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.86 
 
 
400 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.75 
 
 
402 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.53 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
408 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
400 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  30.11 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  33.59 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.7 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  33.24 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  27.08 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
420 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.8 
 
 
414 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
397 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  31.23 
 
 
389 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  32.14 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.52 
 
 
402 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  28.26 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  25.47 
 
 
405 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.92 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.66 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  28.31 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  27.65 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.32 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  36.59 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  23 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.03 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  24.58 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.84 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  29.1 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.69 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  30.82 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.39 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  34.34 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.21 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  29.63 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.19 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.87 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  40.52 
 
 
519 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
462 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  31.74 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
497 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  27.46 
 
 
410 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.25 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  27.46 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  29.01 
 
 
403 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.27 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  27.4 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  27.43 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 
521 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.33 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 
440 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
515 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>