131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1336 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  764    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  54.62 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  54.24 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1055  putative MFS transporter  51.75 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  27.6 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  24.79 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.35 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.43 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  24.72 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  23.4 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  24.38 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  26.59 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.94 
 
 		 1170 aa  53.1  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  24.88 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 476 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  32.5 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  26.97 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.7 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.76 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.8 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  32.82 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  32.22 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2314  hypothetical protein  27.52 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.15 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.62 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  31.53 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  27.48 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>