More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1888 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  768    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  47.79 
 
 		 414 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 412 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 401 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  46.58 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  34.5 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  34.3 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  34.9 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.6 
 
 		 407 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  29.83 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31.96 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  28.29 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.33 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.08 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  30.05 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  28.97 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.21 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.28 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  26.86 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.17 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.78 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43743  multidrug resistance protein 3  26.06 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500194  normal  0.0710927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.67 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.67 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  30 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 558 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  25.79 
 
 		 752 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.74 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  32.67 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.89 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.12 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1004  general substrate transporter  34.69 
 
 		 603 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.08 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.08 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>