More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1004 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1004  general substrate transporter  100 
 
 		 603 aa  1197    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3820  General substrate transporter  54.73 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0419  General substrate transporter  45.6 
 
 		 653 aa  491  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  25.84 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.54 
 
 		 458 aa  154  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  33.25 
 
 		 497 aa  151  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.05 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  29.81 
 
 		 472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.2 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  32.86 
 
 		 493 aa  148  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  30.6 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  26.99 
 
 		 655 aa  147  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.21 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.55 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.79 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.26 
 
 		 468 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.05 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.36 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  33.33 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  31.89 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.77 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.21 
 
 		 478 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.78 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.53 
 
 		 474 aa  140  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.79 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.79 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.79 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.79 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.79 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  31.09 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  32.12 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  29.16 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.16 
 
 		 476 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.66 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  30.9 
 
 		 457 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  31.5 
 
 		 504 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.89 
 
 		 471 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.96 
 
 		 444 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  31.32 
 
 		 430 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.68 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.9 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.32 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  32.2 
 
 		 473 aa  134  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  29.49 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  31.89 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  31.67 
 
 		 544 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.02 
 
 		 446 aa  132  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  29.21 
 
 		 463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.28 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.17 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.31 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  29.92 
 
 		 475 aa  130  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  29.94 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  31.4 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.82 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  29.23 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  29.28 
 
 		 437 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  30.09 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  29.95 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  32.84 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.14 
 
 		 449 aa  128  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.77 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  28.87 
 
 		 448 aa  127  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  28.96 
 
 		 472 aa  127  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  28.96 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  28.96 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  28.96 
 
 		 472 aa  127  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  28.96 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  31.1 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  28.96 
 
 		 472 aa  127  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  28.96 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.35 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  28.96 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.35 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  28.75 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  29.35 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  29.35 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.35 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  29.23 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  28.2 
 
 		 480 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  28.45 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  26.51 
 
 		 477 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  32.95 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  28.18 
 
 		 485 aa  122  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.2 
 
 		 447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  28 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  29.79 
 
 		 468 aa  121  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  29.86 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  30.29 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  30.64 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  29.55 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  30.12 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  31.04 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>