127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2634 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  38.4 
 
 		 414 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  37.86 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 431 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.47 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.58 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  28.38 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  26.15 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  24.2 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  25 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.42 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  27.61 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.36 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  34.51 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  29.3 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  34.02 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  31.65 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  29.75 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  31.3 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.8 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  39.29 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>