161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0339 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  788    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  75 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  75.65 
 
 		 397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  69.87 
 
 		 398 aa  552  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.93 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.41 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.03 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.75 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.03 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.03 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.03 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.67 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.75 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.65 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.47 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.95 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.64 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  23.38 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.71 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  19.47 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.96 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1222  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  23.12 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 525 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.82 
 
 		 529 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.37 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.37 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  23.47 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  23.68 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.57 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  21.29 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  30 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.33 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.89 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 421 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>