155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1490 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  770    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  73.48 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  72.89 
 
 		 397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  69.87 
 
 		 400 aa  552  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.99 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.5 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.5 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.28 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.22 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.22 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.13 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.97 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.97 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  20.56 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 522 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  19.1 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  19.39 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  19.39 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  19.67 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  24.62 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.79 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  30.61 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 525 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  19.11 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.22 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  20.06 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.36 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  19.5 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  19.78 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  22.12 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 539 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  25.49 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 534 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.69 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.69 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 539 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.69 
 
 		 539 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.69 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  27.45 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 534 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  19.39 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  21.88 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  24.58 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>