161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3199 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  814    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.49 
 
 		 407 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  41.26 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  40.91 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.78 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 403 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  33.07 
 
 		 403 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 403 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 414 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  28.28 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  33.44 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.81 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  29.05 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  30.91 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  27.43 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  28.95 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  27.78 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  29.14 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  25.53 
 
 		 409 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.48 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  27.45 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  25.91 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  35.9 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  27.45 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  27.45 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  27.45 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  28.72 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  28.71 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  35.04 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  27.45 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 497 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.25 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  34.19 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  30.91 
 
 		 550 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.78 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  36.63 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>