More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3624 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
431 aa  811    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  39.78 
 
 
415 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  37.08 
 
 
435 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  39.74 
 
 
395 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
414 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  39.47 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  37.82 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  35.98 
 
 
408 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  39.79 
 
 
449 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  39.08 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  40.87 
 
 
402 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 
400 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  40 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
397 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  38.05 
 
 
404 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
420 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
412 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  34.7 
 
 
414 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  36.16 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  33.91 
 
 
410 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  33.91 
 
 
410 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  33.62 
 
 
410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.94 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  32.29 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.87 
 
 
403 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.87 
 
 
403 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.87 
 
 
403 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
415 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
432 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
399 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  28.53 
 
 
530 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 
398 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.75 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.14 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.92 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.61 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  25.25 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  29.12 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.86 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  31.38 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  31.51 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 
419 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  25 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  24.85 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.89 
 
 
361 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.37 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  32.43 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.62 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
512 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
410 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  30.47 
 
 
532 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.37 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  26.73 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.37 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 
532 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  26.19 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  28.83 
 
 
408 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84561  Synaptic vesicle transporter SVOP  27.23 
 
 
604 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  28.43 
 
 
406 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.1 
 
 
429 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.1 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05656  MFS multidrug resistance transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13660)  26.4 
 
 
568 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.481984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.02 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.88 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 
551 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  36.17 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.18 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
505 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.7 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  26.13 
 
 
434 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.36 
 
 
462 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.18 
 
 
538 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.39 
 
 
543 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  24.4 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43743  multidrug resistance protein 3  25.27 
 
 
592 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500194  normal  0.0710927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  32.17 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  30.83 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  33.33 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>