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for query gene lpl1277 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  99.22 
 
 		 386 aa  768    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  772    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.66 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.25 
 
 		 409 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.22 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.44 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.29 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.07 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.51 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.28 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.29 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.68 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  26.29 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.08 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.09 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0325  hypothetical protein  28.89 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  24.5 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  24.79 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.93 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0347  hypothetical protein  28.89 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.96 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  26.13 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  23.45 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.28 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.64 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.71 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 396 aa  95.9  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  25.8 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.68 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.36 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.09 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.09 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.4 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  32.16 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.75 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.37 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  32.16 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  25.33 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.37 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.48 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  23.2 
 
 		 397 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  24.6 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  24.94 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.26 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  25.71 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.75 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  25.71 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  26.7 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  25.71 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.72 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  25.71 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  23.91 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  23.21 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  25.71 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.07 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  22.76 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  23.58 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  25.39 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.56 
 
 		 416 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.11 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  23.64 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  24.15 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.84 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  23.93 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.95 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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