More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4761 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  918    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 465 aa  752    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  95.45 
 
 		 474 aa  863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  96.75 
 
 		 462 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 465 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  85.34 
 
 		 465 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  85.34 
 
 		 486 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  95.89 
 
 		 471 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 486 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  86.43 
 
 		 465 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  67.83 
 
 		 467 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  72.15 
 
 		 465 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  72.15 
 
 		 465 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  72.49 
 
 		 498 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  96.96 
 
 		 471 aa  874    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  99.78 
 
 		 471 aa  915    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  96.96 
 
 		 471 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 465 aa  752    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  68.05 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  65.43 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.37 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.82 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 472 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  44.98 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  45.47 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.3 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.74 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 479 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.7 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 474 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.48 
 
 		 487 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  41.79 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 478 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.22 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  37.58 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  37.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  37.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  37.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.36 
 
 		 475 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.36 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.36 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  36.76 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  36.76 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  36.76 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  36.76 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  36.76 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.82 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 481 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 476 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.34 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 		 474 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  39 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  36.47 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 489 aa  282  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 482 aa  279  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.16 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  36.62 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1135  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.94 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0750633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1575  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.94 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.660118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.94 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.94 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>