77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1094 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  78.32 
 
 		 454 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  78.85 
 
 		 436 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  868    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  82.56 
 
 		 437 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  76.46 
 
 		 441 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  62.62 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  36.25 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  25.89 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.26 
 
 		 474 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  36.17 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  27.08 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  31.58 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  25.75 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  33.33 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  33.33 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  30.86 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  32.71 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  23.63 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.55 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.779737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  32.1 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  32.1 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  32.1 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  32.1 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  33.72 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  30 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  25.56 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.32 
 
 		 1833 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  23.78 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.14 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>