More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1475 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3856  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 
385 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180005  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  61.65 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1220  major facilitator superfamily MFS_1  57.78 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4096  major facilitator transporter  54.76 
 
 
399 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2840  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 
389 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.445566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  30.5 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.5 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.01 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.52 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.83 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.25 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.17 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.53 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.48 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.48 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.48 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  28.24 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.13 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  30.79 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.26 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.39 
 
 
461 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  35.46 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.44 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.44 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.44 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  31.09 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.09 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.55 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.61 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  32.12 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.99 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.69 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.49 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  35.94 
 
 
579 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.19 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  23.17 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
421 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
462 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
534 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.06 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  28.57 
 
 
470 aa  66.2  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  26.67 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  28.86 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.36 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.22 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 
504 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.69 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  35.71 
 
 
499 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.03 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  23.86 
 
 
452 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  26.44 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.32 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.15 
 
 
493 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 
494 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 
646 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 
646 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.8 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 
646 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  33.33 
 
 
492 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  40.38 
 
 
466 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  22.66 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 
474 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 
505 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
483 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 
486 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
790 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>