More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4096 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4096  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  742    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2840  major facilitator superfamily MFS_1  76.35 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.445566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1220  major facilitator superfamily MFS_1  59.02 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3856  major facilitator superfamily MFS_1  57.33 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180005  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  57.86 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.89 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  33.61 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.95 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.57 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.27 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.19 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.01 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.6 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.5 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.81 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.5 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  21.97 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  21.09 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.5 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.5 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.74 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  34.26 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.5 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 		 524 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 435 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.43 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 		 540 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  21.97 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 482 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.36 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.46 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  34.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.62 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.62 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 511 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  30.36 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  32.6 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  34.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>