More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3856 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3856  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 385 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1220  major facilitator superfamily MFS_1  70.16 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  69.59 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4096  major facilitator transporter  58.38 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2840  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.445566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  59.57 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.27 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  36 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.3 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  30.7 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.85 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.85 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  38.18 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.24 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  26.29 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.9 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.67 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  37.42 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  35.14 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.17 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  38.97 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  26.49 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  22.97 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.69 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.21 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  29.64 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.83 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.21 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.83 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>