More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2840 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2840  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.445566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4096  major facilitator transporter  75.54 
 
 
399 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3856  major facilitator superfamily MFS_1  57.22 
 
 
385 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1220  major facilitator superfamily MFS_1  59 
 
 
377 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  55.39 
 
 
401 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  50.4 
 
 
389 aa  225  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  30 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.33 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.27 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.3 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.4 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.72 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  29.71 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.6 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.89 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.44 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.37 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
505 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.5 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.3 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.96 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.13 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.3 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.39 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.75 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.42 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.08 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.37 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.68 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.71 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.16 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.51 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25.07 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.64 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.46 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.37 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.84 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.42 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.15 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.77 
 
 
457 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.37 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 
500 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.32 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.87 
 
 
416 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 
540 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.97 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
399 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  30.4 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  36.84 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  35.33 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  37.5 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  35.44 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 
546 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.51 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  28.98 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
454 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  29.56 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  31.34 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  32.48 
 
 
456 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>