More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4035 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  761    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  95.71 
 
 		 397 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  59.14 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  48.58 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.37 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.37 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.56 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.56 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.7 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.37 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.64 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.5 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.44 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.77 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  27.19 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  28.75 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 498 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25.16 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  29.82 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  24.55 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.68 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.4 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>