42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2072 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 384 aa  736    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  66.52 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  63.74 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 413 aa  329  6e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.54 
 
 		 467 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2962  major facilitator superfamily transporter  28.48 
 
 		 980 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  23.15 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  27.81 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  26.06 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>