230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1619 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  830    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  20.81 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.09 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.52 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.62 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.62 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.04 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  25.16 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.68 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  28.87 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.82 
 
 		 615 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23 
 
 		 592 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.43 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 243 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  26.98 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.43 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  29.27 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  21.9 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 		 508 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.92 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.33 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.45 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  28.18 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 511 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.58 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  27.07 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.97 
 
 		 539 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 497 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.39 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.85 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.13 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.39 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.21 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.57 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.85 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  23.1 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.85 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  28.3 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>