56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3958 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
451 aa  880    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  66.96 
 
 
432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  66.52 
 
 
384 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 
413 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
430 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.94 
 
 
397 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.53 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  29.35 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  22.98 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.32 
 
 
409 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
415 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
918 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
521 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  28.93 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  32.34 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.08 
 
 
579 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.49 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.97 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
513 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.03 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  25 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
497 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  29.67 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  30 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  26.7 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  26.7 
 
 
395 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  30.57 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  32.46 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  32.46 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  32.46 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  32.46 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 
494 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  24.71 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  28.86 
 
 
479 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 
593 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
406 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  26.7 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  29.53 
 
 
470 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>