More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0223 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  794    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.57 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.56 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  26.64 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.95 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  25.91 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  21.7 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  28.1 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.08 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.34 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  30.7 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.19 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  30.7 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  25.55 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  25.18 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.01 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.13 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.29 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 646 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 646 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 646 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.74 
 
 		 685 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 482 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.08 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.8 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000292111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 482 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  27.01 
 
 		 360 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 526 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  26.98 
 
 		 487 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 485 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.46 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.3 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.46 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0064  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  22.95 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>