More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06034 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  716    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  33.15 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  28.33 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.87 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.62 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  29.35 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  29.91 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.87 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.74 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 		 411 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 405 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.66 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.46 
 
 		 410 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.33 
 
 		 410 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.96 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.08 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 409 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.03 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.15 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.84 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.82 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.07 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.09 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.82 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.2 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.58 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.58 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.25 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.42 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.14 
 
 		 426 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  29.68 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.68 
 
 		 409 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.36 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.32 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.57 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.41 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.57 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.96 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.83 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.28 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.34 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.97 
 
 		 412 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.04 
 
 		 454 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.97 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  24.78 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.23 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.26 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.87 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.51 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  24.78 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.26 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.61 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.73 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.62 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30 
 
 		 409 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  28.29 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0064  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.834024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.31 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.33 
 
 		 402 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.81 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.26 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.25 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  26.38 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.38 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  26.7 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.83 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.41 
 
 		 418 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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