More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1778 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  779    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  62.6 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 393 aa  340  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  54.92 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.32 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.54 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.2 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  32 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  27.33 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  28.01 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  34.19 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 540 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 528 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 509 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 464 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 534 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 		 534 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 540 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  32.62 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  34.84 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  23.03 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 516 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 532 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 555 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 526 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73160  putative permease  29.32 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.591701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 514 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>