More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1046 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  741    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  62.83 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  58.51 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  58.93 
 
 		 410 aa  352  7e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.51 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.07 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 460 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  30.5 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 460 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.02 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  35.66 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 534 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.74 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 481 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  30.89 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>