More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1882 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 393 aa  742    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  62.92 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  58.97 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.4 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 646 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  34.71 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 646 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 646 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  29.85 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 530 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  31.3 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 521 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 553 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 490 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  31.25 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.2 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.52 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  29.21 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 506 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 506 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 506 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  33.57 
 
 		 454 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  33.57 
 
 		 454 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 502 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  33.6 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  33.57 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  33.57 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  28.21 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>