More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1879 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
435 aa  843    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  77.89 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 
393 aa  435  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  56.11 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 
400 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.61 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  29.51 
 
 
397 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.03 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  31.03 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  31.03 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.03 
 
 
439 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.5 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  30.17 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  28.91 
 
 
418 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.61 
 
 
439 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.61 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.81 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  29.61 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.85 
 
 
405 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.61 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.93 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.29 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 
534 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.85 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.88 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.78 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  29.36 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  27.61 
 
 
399 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
413 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  32.33 
 
 
406 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  30.34 
 
 
432 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  34.27 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.43 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.52 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  32.84 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  31.03 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.22 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  26.83 
 
 
452 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  30.89 
 
 
514 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.94 
 
 
464 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  28.25 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.93 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  33.61 
 
 
584 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
513 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  29.94 
 
 
464 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  33.12 
 
 
421 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  31.2 
 
 
540 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  37.23 
 
 
386 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  28.35 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
413 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 
505 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  27.78 
 
 
465 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  31.95 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
517 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.2 
 
 
521 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  25.95 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  25.95 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  31.36 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  25.95 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  30.19 
 
 
509 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  28.98 
 
 
454 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  34.03 
 
 
458 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.98 
 
 
410 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  24.91 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  23.98 
 
 
432 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.24 
 
 
438 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.47 
 
 
370 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  28.98 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  25.95 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  25.95 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  31.29 
 
 
389 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.23 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  33.58 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  26.81 
 
 
434 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 
609 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>