More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0062 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  775    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  77.89 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  63.43 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  58.99 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  54.98 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  35.12 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  32.32 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  34.76 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.45 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  34.95 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  33.73 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  29.51 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  34.53 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 513 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 516 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 456 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  31.25 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>