120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1386 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  100 
 
 		 367 aa  707    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0776  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368267  decreased coverage  0.00232333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1200  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 355 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0259923  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0418  hypothetical protein  41.84 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00299596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0844  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313239  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0826  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.978591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0183  multidrug efflux protein  28.38 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  27 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 466 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  26.47 
 
 		 469 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 790 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.39 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  25.63 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.63 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.46 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.59 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5283  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280334  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 469 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26513  MFS family transporter: multidrug efflux  31.37 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853382  normal  0.0548675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  28.18 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  28.18 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.27 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 489 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  29.52 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.45 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.45 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.53 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02584  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01180)  31.3 
 
 		 524 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  35.96 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 490 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 441 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  33.58 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 463 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04590  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02110)  29.63 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.04 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  32.08 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  38.18 
 
 		 590 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  28.91 
 
 		 469 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.88 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  25.61 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  27.56 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 525 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>