82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2371 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 425 aa  854    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.89 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.32 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  22.95 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  28.42 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  20.62 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.5 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.99 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  21.98 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  22.98 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  25.47 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.24 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  21.81 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  23.26 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  24.85 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  27.56 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  28.49 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 357 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  23.67 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.6 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.66 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  26.77 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  24.89 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  21.02 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  27.22 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 		 508 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  27.22 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  27.22 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  26.58 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>