More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0704 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  776    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  30.61 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  26.54 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.77 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  26.68 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  24.73 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  23.97 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.1 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.72 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 		 423 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  30 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  24.71 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  27 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  24.03 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  26.37 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.35 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.71 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.41 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.41 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.41 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.37 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.47 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.42 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  28.92 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.12 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.95 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  28.92 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.77 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 587 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  23.03 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>