200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0134 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
332 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  42.72 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  40.78 
 
 
405 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  31.21 
 
 
392 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  32.99 
 
 
399 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  32.9 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  33.33 
 
 
383 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  32.41 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  32.63 
 
 
398 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
384 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  30.52 
 
 
401 aa  116  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  36.14 
 
 
387 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
378 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  29.19 
 
 
462 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  28.64 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 
478 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 
484 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 
478 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  26.71 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.43 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  27.7 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  28.99 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 
407 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
388 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.86 
 
 
421 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.37 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 
425 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  25.14 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  23.46 
 
 
407 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.36 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
477 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.41 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  24.59 
 
 
394 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.46 
 
 
406 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
383 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
516 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.28 
 
 
522 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  22.39 
 
 
411 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
414 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  28.74 
 
 
423 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
415 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.05 
 
 
423 aa  52.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  25.77 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  23.73 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
537 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  28.14 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  24.12 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
399 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.59 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.17 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  24.86 
 
 
447 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  22.75 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  22.75 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
434 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
404 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  26.37 
 
 
395 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  24.86 
 
 
452 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 
522 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
408 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  23.2 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
511 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  23.24 
 
 
466 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  28.39 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  22.6 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.32 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  25.63 
 
 
543 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  20.85 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  22.6 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  24.21 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  21.21 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  22.35 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  22.11 
 
 
415 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  22.11 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.35 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.35 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>