291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6118 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  97.8 
 
 		 409 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  85.57 
 
 		 409 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  85.33 
 
 		 409 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  85.33 
 
 		 409 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  43.58 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  33.86 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  30 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.59 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.58 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.89 
 
 		 423 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.58 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  36.49 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  31.96 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.12 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  34.33 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  28.52 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.32 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  28.12 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  28.24 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 584 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.96 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  22.06 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  27.92 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.92 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  22.39 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.62 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 850 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.47 
 
 		 592 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>