More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0679 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  100 
 
 		 357 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  33.42 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  27.96 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  27.88 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  27.69 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  31.08 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  34.69 
 
 		 396 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  31.83 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  31.07 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  30.7 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  22.29 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.63 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.23 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.23 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  25.37 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  30.06 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 530 aa  65.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.17 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.08 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.38 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  37.66 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  24.4 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.38 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  24.45 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.46 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.32 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  33.8 
 
 		 515 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  34.84 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>